> Оглавление <

Формат OneCell SVS — TIFF-подобный формат, который призван быть широко совместимым с существующими приложениями для просмотра файлов WSI (whole-slide-image). Данный формат пытается быть совместимым с форматом Aperio SVS для обеспечения широкой поддержки из коробки.

Совместимость OneCell SVS

Формат OneCell SVS должен быть совместимым со следующим ПО:

• Платформа OneCell
  • Чтение пирамиды
  • Чтение метаданных
  • Чтение ассоциированных изображений (thumbnail, macro, label, а также других, которые появятся в будущем)
  • Работа с форматом напрямую без предварительной переконвертации
• Любое ПО, поддерживающее Aperio SVS (QuPath, OpenSlide, BioFormats, ImageScope)
  • Чтение пирамиды
  • Чтение метаданных
  • Чтение ассоциированных изображений (как минимум thumbnail, macro, label)

Документация формата TIFF

<aside> ℹ️ В данном файле можно найти описание полей метаданных TIFF

</aside>

tiff6.pdf

Документация формата Aperio SVS

SVS Image Format Specification (MAN-0466-Rev-B).pdf

Описание формата Aperio SVS

Формат Aperio SVS — это специализированный формат файлов, используемый для хранения изображений слайдов, отсканированных под микроскопом с высоким разрешением. Он основан на формате TIFF и сохраняет изображения в виде многослойных файлов, где каждый слой (или уровень) представляет собой изображение с разным разрешением (от самого высокого до более низкого). Этот формат часто используется в патологии для хранения изображений биопсий и других микроскопических образцов.

Структура формата Aperio SVS

1. Заголовок TIFF:

   Файл начинается с заголовка TIFF, который определяет основные параметры файла, такие как тип файловой структуры (BigTIFF или стандартный TIFF), порядок байтов, и другие базовые данные.

2. Директория файлового изображения (IFD):

   IFD — это структура, которая содержит информацию о каждом изображении (или уровне) в файле. В SVS-файле может быть несколько IFD, каждый из которых соответствует одному уровню разрешения, либо является ассоциированным изображением. В IFD указываются метаданные, такие как ширина, высота, глубина цвета, сжатие и оффсет до данных изображения.